这个事情的FMEA应该是那个部门完成？

这种处理方式根本在应付，不负责任。
问题是对于没有明确质量要求的项目，如果供应商有标准，并且在合同或图纸中有注明，供应商没责任，否则要双方把它当成未尽事项协商解决。
从你描述的问题看是直管直线度和设备不匹配。有可能停机说明了停机是有概率的。代表部分有问题部分没问题。
第一步应急应该确定机器可接受的直线度水平，以此为标准全检。
第二步是退回部分产品要供应商返修，直线度一般都是应力弯曲，可以校直的。
第三步是更改技术规范，明确直线度技术指标。并和供应商达成一致。
第四步确认供应商制程设备有能力满足要求。
第五步反思自己新材料确认过程是否有问题，不一定有问题，因为这件事情是没有技术要求项目供应商公差与厂内可接受公差不匹配。试生产不一定有问题。
你们自己内部生产和技术都有问题，不过因为涉及到技术标准更改，dfmea和pfmea比较，更应该更改dfmea。原因是设计技术指标不全导致的。pfmea不一定要改，pfmea是承接dfmea的，是在合格材料下可预见的风险。