大家好，请教一个现场物料管理的问题

公司以前一直是粗放式的管理方式（公司效益好，掩盖了这种小作坊式管理的弊端），现在领导让我负责做了一套MES管理软件（基于公司事情，自己做的）。我想借着软件上线导入精益生产跟JIT。
但是物流这块一直比较混乱，而且他们也不愿意改变。我想从小地方着手，先试试效果。现在有这么一种情况，我们是总装车间，典型的离散式生产，由于成品种类多，很多东西，库房都是合并发料，然后在车间一堆，就不管了。时间长了之后，车间的物料区已经混的分不清楚哪些物料时那一批次的了。。。请问这种该怎么改善