一个经典的管理难题，你会怎么处理

背景：我手下有一个女工程师（负责IPQA，即过程巡检），有一定工作能力，但工作配合度很差。我的上级老板是一个较为软弱的人，他有一个理念是安排工作要顺被安排者的心意，否则怕人家走了他招不到人。我的管辖范围是手机的SMT和组装，SMT事情很少，组装有三个车间，事情很多。我的上级给我画了组织结构，让这个女工程师负责SMT，让另外一个组长（工人的头）负责组装，然后由我统管。事实显示，这名女工程师的工作极其不饱和，我就有些事情交给她做，不在的时候前后都交接给她。昨天她给我发个邮件，并CC给老板说，按照组织结构，她只负责SMT的事情，其他事情她不处理。
我就这个事情跟我的领导讨论，他的意思是他知道她的工作量很少，但是为了留住人，让我多干点。

我的问题：
我觉得她拿着跟我差不多的工资负责那么少的业务，对我自己和其他人员来说太不公平了，但是苦于领导的表态在那里，很难处理啊！！！