这样的客诉如何处理

前几天我们公司收到一家广州客户的投诉，内容是线绕电阻短装的问题。整件事是这样的：
我们公司的产品包装时自动机台点数包装，每100个产品在编带上打个点，人工包装5000pcs一盒，
发给客户两盒产品总计1万只，客户说两盒都有少，一盒少100PCS,另一盒少300PCS，接到客户投诉后，我马上去仓库调查，仓库同批号的产品还有33500只，我逐一确认数量没有问题啊！真的好郁闷啊，怎么会这么巧，刚好发给他的两盒都会短装，这种事情客户说产品已经用掉了，反正仓库说少，我们现在也没有办法证实，这种投诉真的很郁闷，有理说不清。
大家想想应该怎么处理？