供应商审核的困惑

我是作供应商管理的，公司是日企，大家都知道日企最出名的精细化管理，因此对进入公司合格供应商系统的要求是蛮高且全面的。但是由于我公司产品的特殊性，采购的量并不是很大，因此公司开发的供应商都是以私人民营企业为多（量太少，大公司都不原意做）。在成为我司正式供应商前，需要通过我司的供应商审核(质量体系与现场质量控制相结合）。说实话，我去审核过的公司，都是通过ISO质量体系认证的（现在这东西只要有钱都能买），但实际上有些公司连最基本的体系文件也没有，很多公司对于产品的各工程（包括受入，工程巡检，完成品）的检查是不实行的，按照公司的审核要求肯定是不行的。但是其报价是购买所满意的，而且送样的产品质量也达到要求的。像这样的公司该如何抉择呢？