老板可以直接插手部门工作安排？

我们品管部有三个检验员
以前一直是一个负责进料和出货；另两个负责首巡检，白中两班倒
由于今年企业生产任务不多，所以进料出货也几乎没有
前两天我们部门进行调整了一下，让其中一个巡检去工序上做全检了（计件的），他当然有情绪，所以直接找老总解决问题
老总怎么对他讲的我不知道
可老总对我说，我给他定位（这个巡检）是巡检......不过考核还是要我考核他（巡检）
我不知该怎么说了，答应着走出老总办公室

老总已经安排他了，并且也不先问我一下：调岗之类的事情，直接安排好后（并且和我安排的工作大相径庭）再告诉我，让我怎么回答老总？以后再怎么去安排他和其他人呢？怎么管理呢？
大虾们有没有遇到过此类事情，说说你们怎么处理的？