公司没有推体系，下面的情况该如何处理？

公司没有推行体系，但有客户的品质验厂，客户也有给清单。接手工作就是零零散散的文件，没有质量手册。当时决定重新编写一套文件，并且进行了实施。三个月后发现：文件和实际脱节。我也只是应付客户验厂通过即可。
现在问题：3月份左右客户审核，现在正赶上体系换版的时候，那么这个时候我是在原来文件的基础上进行换版呢还是就直接按照2008版的进行再编写。
有再编写的想法是因为：当时询问的相关人员是公司没有设计于是将7.3条删除。现在发现其实公司是有自己的设计和开发的。