请问各位：出厂合格证上的印章该盖哪个部门的？

本人在公司负责产品出厂合格证的编制，奇怪的是，这次公司有新产品出厂，工程部门的主管却擅自改了合格证的格式，并在合格证上签了他的名字。。
那个主管是个非常厉害的角色，进公司短短三年，公司工程部的所有研发工程师包括技术总监都相继离开，现只有本人还没离开，因为本人不搞研发。各位帮我分析一下，是否到了排挤我出局的时候了？我该怎么处理比较好？