程序文件的编号控制

我们公司现在处于无文件化的管理状态，为了应付客户，每次都是在客户要来的时候补文件，过后，文件又丢了。所以，现在出现了以前的文件有好几个版本的情况。我现在要将所有的文件全部整理，并且受控，那么这些之前的文件我是否就可以不要那些编号呢（因为他们老员工都不知道他们用的哪个版本），全部按照我现在的编号方法进行。这样可行吗？如果可行的话，那么我的文件修改记录就是从现在开始做了？如果不可行的话，那么我要怎么样去做最合理呢？在文件修改记录上又要写哪个版本呢?
备注：我们未通过ISO9000