组织未能提供识别的适用的工具和技术知识。

1.这也太牵强了吧，应该是审核老师为难你们，个人认为不同企业有不同的管理方法和生产工艺体系，体系标准只是个框架，适不适合企业应该是由企业说的算的，审核老师可以提出改进建议，但不应该纳入不符合项，为了尽快通过审核建议你与审核老师再进行沟通确认具体情况，并可以咨询和商量下要如何改进，然后有针对性的去落实改进措施（注意沟通时就事论事，不要展开遐想，这个事的范围可大可小）。
2.无论是全自动化生产，还是手工生产，只是方法不同而已，这和企业规模、资金、产品复杂程度等等因素都有关系，个人认为没有好不好，只有适合不适合企业现阶段的需求。
3.至于技术知识那就更没办法说了，大型企业有完善的培训体系，分工更细，招聘时对人员技能的要求不高；小企业培训体系一般不是很健全，对人员的技能要求就高，招聘时更注重工作经验。