Project operation的公司内部如何对车间的生产进度进行很好的管理

工厂的运作方式是Project Operation， 不是product mass production。 也就是说生产的产品是周期长的单个个体产品， 例如大的空分设备和压力容器。
现在的问题是，如果有多个项目或产品同时进行， 项目计划也是按照优化的方法进行schedule，但是在车间生产的执行层面上几乎不按照项目计划来（只是控制开头和结尾）， 例如原来的计划是1车间先做项目1的东西， 再做项目2的东西， 但是，车间认为项目1和项目3的东西相似，做法相同， 所以先做项目1，再做项目3的东西， 最后做项目2的东西， 这样造成了后道工序的等待和调整。
另外还有客观因素造成的， 例如再做项目1的时候因为图纸或是材料的未到货，造成车间计划不得不调整。

请教大侠如何对此类生产模式的项目计划和车间计划的匹配和执行有好的建议和经验。。

谢谢先。