同志们这种情况我该怎么办，要越级上报吗？

公司是新开的，正在搞ISO认证，在这个时候我被招入品质部，但没有任何头衔，品质部有三个人，一个负责仪器检测性能，我负责车间质量，还有一个部长是技术部部长兼任。今天我发现一批产品公差达不到客户订单，报品质部长，他说这个按理是不合格的，让我找他的助手生产调度，生产调度说让我在入库单签字备注就可以。我当时忍了，签字备注。可是快到12点时刚好进过成品仓库在打包，一看正是早上这批问题产品，包装指令单上写的是正品，没有任何备注。
当时我很很很生气，可是我一个小小QC能做什么？我想直接报告老板，可是又觉得这是越级上报，一个普通员工的话有可信度吗？我犹豫了，可是我真的很难受这种感觉。
坛子里德同志们，你们都是同行，说说我该怎么做？