如何管控大批量生产的产品

现在我们公司有一个关于食品级的项目上来，跟公司之前的经营范围都有很大的不同，因为是食品级代工产品，客户不允许我们出现我们公司QC的pass标识，整个外箱也要求的相当严格（不允许脏污、不允许不相关字迹，产品信息贴在指定位置等）……也就因为这样，产品每天出货近1000箱产品，每箱5000个以上，又没有任何标识，我们质量部门难以管控，包括未返工直接出货却难以追溯，有高手碰到如此问题，或者能给我点建议么？
哥们儿谢过了……