作业员没有按作业指导书作业怎么办？

向大家请教个问题？如果作业指导书规定要每个工序都要确认部品的数量，但在出货到客户处的部品还是少了数量，跟客户当时送来的数量不一致，客户投诉少了数量，之后查找原因，每个工序都认为没有错，但最终还是查明了原因是在某一岗位没有确认！如果遇到类似问题你们公司都是如何处理的？目前我们公司也没有对操作错误的员工进行处罚，如果处罚是不是最好的良药呢？