过程审核应该审到哪一步？

案例：
某工位发生质量问题，进行制造过程审核，审核依据是VDA6.3（B部分），审核发现1.该工位没有作业指导书；2.后续的检验工位对此工位安装的零部件的检验要求也不明确或者说不全面。
本人认为制造过程审核审到此步可以结束了，但有不同意见，认为应该继续深挖系统问题。
深挖结果：车间及公司有文件要求每个工位及零部件都要求编制作业指导书，即此文件要求没有得到很好的执行；控制计划中对零部件的外观质量有明确规定且要求检验，但此要求没有被转化到车间作业（当然没有作业指导书就已经是问题了）及检验指导书中。
问题：两种审核结果哪一种更好？前提是过程审核的结果。本人认为是第一种，很明显它违反了VDA6.3B的条款：生产及检验文件是否标示出全部的重要事项并得到遵守？至于第二种审核结果本人认为应该是体系审核的结果更合理一些。请问各位有什么高见？过程审核应该审核到哪一步？