各子公司的程序文件必须与集团一样？改动必须集团一起更改？

上个月到现在这家台资公司就职体系工程师，之前做体系也已经3年多时间，现在在这边才做了一个月就发现这边的体系文件改动真的非常困难啊！
刚来的那几天就仔细研究了几份程序文件，发现程序文件有些问题，有很多要点程序文件中都没有规定，比如程序文件没有修改履历，如何对新文件编号、升级描述不清，未有规定PPAP的提交等级，程序文件与程序文件之间描述矛盾等等，然后我就想从文件更改做起吧，结果我们主管告诉我说分公司这边没办法修改程序文件，必须通过总部修改。我当时脑子里立马冒出一个词：WHAT？之后我就将这些问题反馈总部了，结果催了几次、提了几次还是没消息了，后来这边技术的主管告诉我说：这边只要涉及到总部的就永远石沉大海了。。。。。。。
真不知道这是哪个奇葩想出来的，各个子公司的程序文件要完全一致，而且子公司还没有修改的权利。他难道不知道理论要与实际结合吗？每个子公司的条件、环境都不一样，更何况客户也不一致啊，如何统一？每个子公司客户的要求难道都要完全统一到程序文件中，然后各个子公司一起执行吗？真实没事找事啊？
上次客户审核也提出了很多程序文件要改动的地方（包含我之前提过的），但是程序文件没办法修改弄得我非常被动；日常审核也会涉及到文件的更改，也没办法执行。。。。。。。
现在真的是非常苦恼、纠结啊，不知道该如何主导这个体系了。。。。