现在的局面，我该如何选择？

各位前辈们，现在我将我的工作中的具体情况给大家进行叙述，请大家帮忙看看，我该何去何从？
2012年9月份，我进入这家以研发为主的小型电子企业，生产外包。职位为QA，一年多的工作中，我学会了很多，自己觉得能力方面有很大的提高。
从2012年9月一直到今年7月，我一直在梳理公司各个部门的流程，终于弄得有模有样，公司领导通知我，公司准备导入IRIS体系，国际铁路行业标准，基于TS16949，ISO9001，增加了铁路的各方面严谨要求，对于我来说，更是一个好的学习机会。并且公司已IRIS为一个项目进行，任命我为项目经理，让我全权负责IRIS一切事宜。从联系咨询公司、联系老师，到编制文件等，我全都操心。咨询公司派几位资深的老师来我公司进行培训：标准讲解、项目管理培训、RAMS/LCC培训及现场审核文件，发现质量工程师要在这个项目中担当重要的角色。并且之前在学校课堂之所学，也会应用很多，我十分欣慰。并且通过辅导老师到我公司辅导的过程中，公司的领导对于我的专业方面的知识给予了相当大的肯定。总之，这对于我来说是个不错的机会。
作为质量部QA，我严于律己，尽责职守。不幸的事是谁都没想到的，由于公司采购部副总经理采购的物料为假货，该产品相当于我们帮客户代买的，我公司也没有验证能力，给我们的客户带来十分严重的损失，因此我们的客户对我们停止付款，并且暂时取消我们公司供应商资格。身为公司的一员，因为此事我也很纠结。现在就明摆着业务不好，公司的年终奖还不知怎么着呢，我觉得凭借这我一年多来的努力，如果一切都没发生，我年终会得到好的回报的。但是现在这个情况，我也为之担心，我也希望我们大领导挺过这一关。现在各部门均忙着各自的事，大家也没时间和精力编制IRIS体系文件，因此我们开会决定，这个项目暂时推迟一个月，等到过了年，再开始弄这个体系。我质量部从非常忙变成不忙，自己的事情倒是弄得非常利落，现在就是抽空做点其他部门的文件。
在我心中的疑问，年后，IRIS项目能照常进行么？未知，非常肯定的是明年的业务肯定比不了今年，所以我自己的内心开始嘀咕。自己表现的好有什么用啊，还不是因为公司的一个人，耽误公司所有人，我们所有人陪着这个买假货的人玩了一年。旁观者角度来看，昔日的朋友变成了仇人。
我也曾经想过，作为我，必须要进大公司，如果我真的决定换工作，那么我这次要谨慎而行，首先行业最重要。但是为了我的良知，我静观其变，不到万不得已，不做选择。
如果是你们，你们怎么想呢，会怎么做呢？？？